سید مرتضی ابطحی: اطلاع از نام کامل شاگردان آیت الله العظمی بهجت با توجه به تعداد زیاد شاگردان ایشان و منابع اطلاعاتی محدود کار آسانی نیست. در این نوشتار سعی شده است تا براساس اطلاعات موجود، علاوه بر ذکر اسامی بعضی از چهره های شاخص شاگردان ایشان، شناخت اجمالی از این شاگردان ارائه دهیم:

محمد تقی مصباح یزدی: وی که یکی از شاگردان اصلی آیت الله بهجت محسوب می شود، علاوه بر عضویت در مجلس خبرگان رهبری، ریاست شورای عالی مجمع جهانی اهل بیت و موسسه آموزشی و پژوهشی امام خمینی را نیز بر عهده دارد.

علی اکبر مسعودی خمینی : وی در حال حاضر تولیت حرم حضرت معصومه (س) را به عهده دارد.

مرحوم سید مهدی روحانی: او نماینده خبرگان قم و از اعضای بلندپایه جامعه مدرسین بود. خانواده روحانی از خانواده های سرشناس قم محسوب می شوند. دو پسر عموی سید مهدی یعنی، سید محمد و سید صادق روحانی از عالمان سرشناس قم هستند.

ابوالقاسم خزعلی: وی علاوه بر عضویت در مجلس خبرگان قانون اساسی، به طور متوالی در سه دوره به نمایندگی مجلس خبرگان از سوی مردم خراسان انتخاب شد. وی همچنین از اعضای جامعه مدرسین و شورای نگهبان قانون اساسی بوده است. وی در مجلس ختمی که از سوی جامعه مدرسین برگزار شد، گفت: «پس از فوت آیت الله العظمی بروجردی قم شاهد چنین تشییع جنازه ای نبود.»

محمد ری شهری: وی تولیت آستان امامزاده عبدالعظیم شهر ری و رییس موسسه فرهنگی دانشگاه دارالحدیث. وی علاوه بر آن در حال حاضر سرپرست حج و اوقاف نیز است. ریاست دادگاه انقلاب ارتش، وزیر اطلاعات، دادستان کل کشور، دادستان ویژه روحانیت، نمایندگى مردم تهران در مجلس خبرگان رهبرى از جمله مسئولیت های پیشین وی محسوب می شوند.

سید محسن موسوی گرگانی: وی از اساتید حوزه علمیه قم است که در حال حاضر علاوه بر تدریس خارج فقه و اصول به تدریس فلسفه نیز مشغول است.

مرحوم علی پهلوانی تهرانی: از روحانیونی که بیشتر جنبه عرفانی داشت. وی مدت ??سال در محضر علامه طباطبایی حضور یافت؛ مجموعه از نوشته های علامه تفسیر اشعار حافظ توسط آن مرحوم گردآوری و به انتشار رسید.

محمدهادی فقهی نیز نویسنده و مترجم و کتب و مقالات دینی است. وی کتاب سنن النبی علامه طباطبایی را که مجموعه ای از کارهای پیامبر اکرم است به فارسی ترجمه کرده است.

محمد حسن احمدی فقیه یزدی از اساتید حوزه قم است که از بیش از سی تن از عالمان دینی اجازه اجتهاد دارد. وی در روش اجتهاد خود تأکید خاصی بر قرآن دارد.

محمد حسین احمدی فقیه یزدی. برادر محمد حسن احمدی فقیه یزدی است که هر دو از عالمان سرشناس یزدی هستند.

مهدی هادوی تهرانی. او علاوه بر تدریس دروس خارج در حوزه علمیه قم، با دانشگاهها و مراکز آموزش عالى کشور همکارى علمى دارد. وى عضو شوراى بررسى متون علوم انسانى وزارت علوم، تحقیقات و فناورى و رئیس گروه فقه و حقوق این شورا و عضو شوراى علمى کارشناسى ارشد فلسفه علم دانشگاه صنعتى شریف است.

محمود امجد. استاد اخلاق مشهور ?? ساله که علاوه بر درس آیت الله بهجت از محضر حاج آقا حسین فاطمی، و آیت الله بهاءالدینى و علاّمه طباطبایى استفاده نمود. وی که هم اکنون تهران است، جزء روحانیون متنفذ در بین قشر جوان دانشجو و روحانیون جوان قم محسوب پمی شود. امجد مدتی امام جماعت کوی دانشگاه تهران بود.

عزیزالله خوشوقت، از اساتید اخلاق شناخته شده حوزه علمیه تهران است. وی از لحاظ سیاسی از منتقدان جدی سید محمد خاتمی به شمار می رود. او در نهمین دوره انتخابات ریاست جمهوری از حامیان احمدی نژاد بود. وی در انتخابات خبرگان رهبری کاندیدای رایحه خوش خدمت در تهران بود ولی در رأی کافی نیاورد. دختر وی عروس آیت الله خامنه ای می باشد.

سید مصطفی خامنه ای: وی فرزند آیت الله خامنه ای و داماد آیت الله خوشوقت است.

سید صابر جباری: وی چندین دوره خبرگان بوده و در حال حاضر نیز نماینده خبرگان رهبری و امام جمعه بهشهر است.

حسن لاهوتی: وی از روحانیون مبارز انقلابی بود که به دستور امام خمینی برای تبلیغ دینی به گرمسار رفت و آنجا فعالیت نمود. وی از هواداران سازمان مجاهدین خلق در سال های پیش از انقلاب بود. در عین حال او پس از اعلام تغییر ایدئولوژی سازمان، بیانیه ای علیه سازمان مبنی بر نجس بودن مجاهدین را امضا کرد. لاهوتی در سال ?? از دنیا رفت.

سید رضا حسینی نسب: وی در حال حاضر مقیم کشور کانادا است. مدیریت و امامت مرکز اسلامی هامبورگ تا سال ???? بر عهده او بود.

حجت الاسلام عبدالمجید رشید پور نویسنده کتب و مقالات دینی است.

مختار امینیان از نمایندگان خبرگان رهبری در استان گیلان است.

مرحوم صادق احسان بخش: وی پس از اخذ لیسانس از دانشگاه معقول و منقول به قم آمد و درس طلبگی خواند. او امام جمعه سابق رشت و از اعضای مجلس خبرگان بود.

زین العابدین قربانی : امام جمعه فعلی رشت

هادی قدس.

سید رضا خسروشاهی.

اسماعیل عابدی.

عزیز علیاری

سید محمد مؤمنی

حسین مفیدی

محمد کریم پارسا

جواد محمد زاده تهرانی

شهید نمازی شیرازی

محمد ایمانی